在重度抑郁想离婚的情况下，离婚协议中需要特别注意保护自己的身心健康和经济权益。根据《民法典》第一千零七十六条关于协议离婚的规定，双方应签订离婚协议书，明确子女抚养、财产以及债务处理等事项。鉴于你的特殊情况，建议在协议中明确心理健康支持条款，如对方不得进行精神虐待，以及财产分割时考虑你的治疗费用和生活保障。同时，可依据《民法典》第一千零九十一条，若对方有过错，可主张损害赔偿。
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若选择诉讼离婚，法院会根据《民法典》第一千零七十九条的规定进行审理。在此过程中，法院会考虑你的重度抑郁情况，可能涉及以下几点：1. 你的精神状态可能影响诉讼能力，法院可能指定代理人；2. 抑郁情况可作为感情破裂的证据之一；3. 在财产分割和子女抚养上，法院会倾向于保护弱者，考虑你的治疗需求和生活安排。
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从法律角度，离婚时确保自己合法权益不受侵害，可注意以下几点：1. 保留相关证据，如医疗证明，证明你的抑郁情况；2. 咨询专业律师，了解法律程序和自身权益；3. 在协议或诉讼中，明确子女抚养、财产分割等条款，确保公平合理；4. 若对方有暴力或虐待行为，及时报警并告知法院，申请保护措施。