民事法庭与刑事法庭、行政法庭的区别主要在于审理案件类型及权利不同。民事法庭处理民事纠纷，刑事法庭处理刑事案件，行政法庭则处理行政案件。依据《中华人民共和国民事诉讼法》《中华人民共和国刑事诉讼法》等，各法庭具有不同的审理权限和程序，错误处理可能导致社会公平正义受损，严重影响社会秩序。
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民事、刑事、行政法庭各司其职。民事法庭处理民事纠纷，如合同、侵权等；刑事法庭审判刑事案件，如盗窃、杀人等；行政法庭则负责行政诉讼。具体操作需根据案件类型选择对应法庭进行起诉或应诉。
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民事法庭、刑事法庭与行政法庭处理案件的方式各异。民事法庭常通过调解与判决解决民事争议；刑事法庭则对刑事案件进行审判，涉及刑罚；行政法庭处理行政违法行为。选择处理方式需根据案件性质确定，民事纠纷选民事法庭，刑事案件选刑事法庭，行政争议选行政法庭。